Самостоятельный расчет характеристик и неправильный подбор оборудования часто приводит к увеличению затрат на дальнейшее обслуживание системы. Некоторые показатели, такие как рН, косвенно влияют на окисление железа (в тех случаях, когда концентрация Fe2+ больше 2 мг/л), поэтому подбор оборудования лучше доверить специалистам. На выбор станции водоочистки влияет не только химический анализ и источник водоснабжения, но и производительность. Самостоятельный расчет приводит к тому, что иногда не хватает напора для подачи воды во всех точках разбора. Одновременно с этим, система с высокой производительностью не рациональна в денежном плане (увеличиваются расходные материалы и стоимость сервисного обслуживания, происходят застои воды). Сбои в работе оборудования могут привести к снижению срока эксплуатации всей системы.